Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms