Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf394Q9Z1D9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Znf394Q9Z1D9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms