Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setbp1Q9Z180 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms