Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sumo3Q9Z172 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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