Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp2Q9Z0E6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms