Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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