Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh13Q9WTR5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh13Q9WTR5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms