Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms