Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms