Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt71Q9R0H5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms