Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NrkQ9R0G8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NrkQ9R0G8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms