Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms