Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek3Q9R0A5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms