Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms