Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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