Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc4Q9QZD4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms