Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Irx4Q9QY61 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irx4Q9QY61 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irx4Q9QY61 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irx4Q9QY61 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irx4Q9QY61 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms