Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxe3Q9QY14 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms