Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr2e3Q9QXZ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms