Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms