Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms