Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rabgef1Q9JM13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rabgef1Q9JM13 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rabgef1Q9JM13 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1Q9JM13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms