Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms