Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Msrb1Q9JLC3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msrb1Q9JLC3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms