Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gde1Q9JL56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gde1Q9JL56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms