Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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