Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms