Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms