Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms