Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms