Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uchl3Q9JKB1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms