Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpa33Q9JKA5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms