Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smpd3Q9JJY3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smpd3Q9JJY3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smpd3Q9JJY3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smpd3Q9JJY3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smpd3Q9JJY3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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