Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms