Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tssc4Q9JHE7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tssc4Q9JHE7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tssc4Q9JHE7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tssc4Q9JHE7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tssc4Q9JHE7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms