Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp6Q9ESX2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms