Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc28a3Q9ERH8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms