Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms