Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms