Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn12Q9ER56 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms