Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Igdcc4Q9EQS9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms