Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pold3Q9EQ28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms