Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC69

Ndufa9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa9Q9DC69 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufa9Q9DC69 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufa9Q9DC69 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufa9Q9DC69 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms