Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms