Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms