Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf580Q9DB38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf580Q9DB38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf580Q9DB38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf580Q9DB38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf580Q9DB38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf580Q9DB38 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf580Q9DB38 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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