Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp2aQ9DB34 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms