Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc89Q9DA73 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms