Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem239Q9DA47 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms