Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms